helixview.py 
from helixview import Structure

model = Structure.load("8R1A")

model.explore()

Help build a free molecular viewer for students, researchers and independent open-source contributors.

Explore HelixView Become a contributor

Komunitní balíčky

Rozšíření, importéry a nástroje pro HelixView postavené komunitou. Volně k použití, úpravám i sdílení.

Vlastní render plugin pro HelixView Plugin

Vlastní render plugin pro HelixView

Vykreslovací plugin pro externí knihovny i nestandardní reprezentace molekul. Obsahuje příklady synchronizace různých typů dat mezi pluginem a jádrem aplikace.

  • Publikace pluginu přes registr balíčků HelixView
  • Sestavení rozšíření pomocí HelixView SDK
  • Vlastní panel přímo v pracovní ploše

Přispěl Tomáš Brückner

Přejít do katalogu
Importér struktur PDB a MOL Import

Importér struktur PDB a MOL

Načítání molekulárních struktur z formátů PDB, MOL a SDF přímo do scény. Mapuje atomy, vazby i metadata na datový model HelixView a připraví je k vizualizaci.

  • Dávkový import celých knihoven struktur
  • Automatické rozpoznání vazeb a hybridizace
  • Validace geometrie před importem do scény

Přispěla Klára Hofmanová

Přejít do katalogu
Měřicí a anotační nástroje Nástroje

Měřicí a anotační nástroje

Přesné měření vzdáleností, úhlů a torzí spolu s textovými anotacemi ukotvenými přímo ve 3D scéně. Vše zůstává navázané na konkrétní atomy.

  • Vzdálenosti, úhly a torzní úhly v reálném čase
  • Trvalé anotace ukotvené ke konkrétním atomům
  • Export naměřených hodnot do tabulky

Přispěl Martin Žák

Přejít do katalogu
Export do publikační kvality Export

Export do publikační kvality

Snímky a vektorové výstupy připravené k publikaci. Nastavení rozlišení, stylu vazeb i barevných schémat podle šablon odborných časopisů a reprodukovatelné scény.

  • Vektorový i rastrový export ve vysokém rozlišení
  • Přednastavené styly pro odborné publikace
  • Reprodukovatelné scény přes konfigurační soubor

Přispěla Eva Marešová

Přejít do katalogu
01 — 04
Chcete přispět? Zjistěte, jak vytvořit a nasadit své první rozšíření. Začít

Postavte si vlastní HelixView

Open source jádro, otevřené API a aktivní komunita. Vyberte si, kde chcete začít.

Otevřít repozitář
Dokumentace Instalace, API reference a průvodci tvorbou vlastních rozšíření. Video návody Od první scény po vlastní plugin, krok za krokem. Komunita Diskuze, dotazy a zpětná vazba s ostatními vývojáři. Vydání a changelog Co je nového v každé verzi a plán dalšího vývoje.